Quartet of Villains

Ninja

Master Wu · Lloyd · Kai · Jay · Cole · Zane · Nya
Allies: P.I.X.A.L. · Misako · Dareth · Ronin · Cyrus Borg · Falcon
Former Members: Master Garmadon

Skulkin

Samukai · Wyplash · Kruncha · Frakjaw · Chopov · Nuckal · Krazi · Bonezai

Serpentine

Anacondrai: Arcturus · Pythor · Anacondrai Generals
Fangpyre: Fangtom · Fangdam · Fang-Suei · Snappa
Venomari: Acidicus · Lizaru · Spitta · Lasha · Zoltar
Constrictai: Skalidor · Bytar · Chokun · Snike
Hypnobrai: Skales · Slithraa · Mezmo · Rattla · Selma · Skales Jr.
Other: The Great Devourer · Anacondrai Serpent

NGTV News

Dan Vaapit · Fred Finely · Gayle Gossip · Vinny

Pirates

Leader: Captain Soto
First Mate · No-Eyed Pete

Stone Army

Creator: The Overlord
General Kozu · Giant Stone Warrior · Stone Warrior · Stone Swordsmen · Stone Scout

Nindroids

General Cryptor · Nindroid Drone · Nindroid Warriors · Min-Droid

Anacondrai Cultists

Leader: Chen
Clouse · Zugu · Eyezor · Kapau · Chope · Krait · Sleven
Former Member: The Mechanic

Elemental Masters

Current Elemental Masters: Ash · Bolobo · Chamille · Gravis · Griffin Turner · Jacob Pevsner · Karlof · Neuro · Paleman · Shade · Skylor · Tox
Previous Elemental Masters: Cole's Grandfather · Griffin Turner's Grandfather · Jay's Mother · Cole's Mother · Master of Gravity · Master of Ice · Master of Light · Master of Shadow · Master of Sound · Maya · Ray · Skylor's Mother

Ghost Warriors

Leader: The Preeminent
Morro · Chain Master Wrayth · Blade Master Bansha · Scythe Master Ghoultar · Bow Master Soul Archer
Ghost Ninja: Attila · Hackler · Howla · Ming · Spyder · Wooo
Ghost Warriors: Cowler · Cyrus · Ghurka · Pitch · Pyrrhus · Wail · Yokai

Sky Pirates

Leader: Nadakhan
Flintlocke · Dogshank · Doubloon · Monkey Wretch · Clancee · Bucko · Cyren · Skeleton Figurehead
Former Members: Dilara · Squiffy

Ninjago Police

Police Commissioner · Tommy · Simon · Noonan · O'Doyle · Jimmy · Policeman · Night Watchman

Temple of Airjitzu Ghosts

Master Yang
Yang's Students: Chris · Martin · "Chuck"

Shadow Army

Leader: Clouse

Vermillion

Creators: Acronix · Krux
Machia · Raggmunk · Blunck · Vermin · Rivett · Slackjaw · Tannin · Buffmillion

Sons of Garmadon

Leaders: Harumi · Lord Garmadon
Killow · Ultra Violet · Mr. E · Luke Cunningham · Chopper Maroon · Mohawk · Sawyer · Scooter · Buffer · "Snake Jaguar" · Colossus

Ninjago Royal House

Emperor of Ninjago · Empress of Ninjago · Princess Harumi · Hutchins · Royal Guards

Dragon Hunters

Leader: Heavy Metal
Jet Jack · Skullbreaker · Arkade · Muzzle · Daddy No Legs · Chew Toy · Talon · Nitro · "Rocky Dangerbuff" · "Dangerbuff Junior" · Stalwart Dangerbuff · Otto Pilot
Former Member: Iron Baron

Oni

Leader: The Omega
Former Member: Mistaké

Pyro Vipers

Leader: Aspheera
Char · Pyro Destroyers · Pyro Slayers · Pyro Whippers
Former Members: Mambo the Fifth · Mambo's Advisor

Blizzard Samurai

Leader/Creator: Ice Emperor
General Vex · Grimfax · Blizzard Warriors · Blizzard Sword Masters · Blizzard Archers · Frostbeard

Formlings

Leader: Formling Leader
Akita · Kataru · Vex

Ice Fishers

Leader: Sorla
Uthaug · Boma

Paperboys

Leader: Sammy
Lil' Nelson · Antonia · Leroy

Explorers Club

Leader: Cecil Putnam
Percy Shippelton · Smythe · Underhill
Former Member: Clutch Powers

Prime Empire Gamers/AI

Creator: Milton Dyer
Ballistic Missiles: Anthony Bruton Nelli
Chrome Domes: Hyper-Sonic
Admin Droid · Adventure-Ready Woman · Avatar Pink Zane · Okino · Racer Seven · Scott · Shifty · Successful Samurai
League of Jays: Beta Jay 137 · Dee-Jay 81 · Jaybird 64 · Jaywalkin 238

Unagami's Army

Leader: Unagami
Sushimi · Sushi Waitress · Avatar Harumi · Aerial Drones
Red Visors: Red 27 · Red 29
Allies: The Mechanic · Captain Soto · Ultra Violet · Hausner · Richie · Ritchie · The Mechanic's Henchmen

Whack Rats

Leader: Atta the Ratta
Hausner · Richie · Ritchie

Skull Sorcerer's Warriors

Leader: Skull Sorcerer
Awaken Warriors
Orcs: Murt · Moe
Geckles: Gleck · Ginkle

Non-Canon

Quartet of Villains · Gahrann the Dreamer · Hibiki · Kirchonn the Invincible · Mask of Malice · Time Ninja · Lar · Seliel · Seliel's Father · Neido

Creatures

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Fusion Dragons: Ultra Dragon · Hydro Electric Dragon · Fusion Dragon

Other

Benny · Bob the Intern · Brad Tudabone · Carridi · Cathy · Claire · Cliff Gordon · Cragger · Dr. Berkman · Dr. Julien · Dr. Yost · Echo Zane · Ed · Edna · First Spinjitzu Master · Fenwick · Finn · Fugi-Dove · Gene · Genn · Grumbmiller · Hageman Brothers · Harumi's Mother · Harumi's Father · Hibiki · Jake · Jay Vincent · Jesper · Juggernaut · Khanjikhan · Khanjikhan's Father · Laval · Lou · Master Whoosh · Michael Kramer · Mistaké · Nadakhan's Mother · Nobu · Patty Keys · Phantom Ninja · Postman · Rachel Sparrow · Restaurant Owner · Robo Usher 3000 · Rodrigo · Roise · Rufus MacAllister · Sally · Sparring Robot · Suzie Wheeler · Tai-D · Tour Bus Driver · Vania · Vlad Tutu · Warden Noble · Wohira
Bizarro Ninja: Bizarro Cole · Bizarro Jay · Bizarro Zane · Bizarro Kai