Shadow Dragon

Ninja

Master Wu · Master Lloyd · Kai · Jay · Cole · Zane · Nya
Allies: P.I.X.A.L. · Misako · Dareth · Ronin · Cyrus Borg · Falcon · Okino
Former Member: Master Garmadon

Skulkin

Samukai · Wyplash · Kruncha · Frakjaw · Chopov · Nuckal · Krazi · Bonezai

Serpentine

Anacondrai: Arcturus · Pythor · Anacondrai Generals
Fangpyre: Fangtom · Fangdam · Fang-Suei · Snappa
Venomari: Acidicus · Lizaru · Spitta · Lasha · Zoltar
Constrictai: Skalidor · Bytar · Chokun · Snike
Hypnobrai: Skales · Slithraa · Mezmo · Rattla · Selma · Skales Jr.
Other: The Great Devourer · Anacondrai Serpent

NGTV News

Dan Vaapit · Fred Finely · Gayle Gossip · Vinny

Pirates

Leader: Captain Soto
First Mate · No-Eyed Pete

Stone Army

Creator: The Overlord
General Kozu · Giant Stone Warrior · Stone Warrior · Stone Swordsmen · Stone Scout

Nindroids

General Cryptor · Nindroid Drone · Nindroid Warriors · Min-Droid

Anacondrai Cultists

Leader: Chen
Clouse · Zugu · Eyezor · Kapau · Chope · Krait · Sleven
Former Member: The Mechanic

Elemental Masters

Current Elemental Masters: Ash · Bolobo · Chamille · Gravis · Griffin Turner · Jacob Pevsner · Karlof · Neuro · Paleman · Shade · Skylor · Tox
Previous Elemental Masters: Cole's Grandfather · Griffin Turner's Grandfather · Jay's Mother · Cole's Mother · Master of Gravity · Master of Ice · Master of Light · Master of Shadow · Master of Sound · Maya · Ray · Skylor's Mother

Ghost Warriors

Leader: The Preeminent
Morro · Chain Master Wrayth · Blade Master Bansha · Scythe Master Ghoultar · Bow Master Soul Archer
Ghost Ninja: Attila · Hackler · Howla · Ming · Spyder · Wooo
Ghost Warriors: Cowler · Cyrus · Ghurka · Pitch · Pyrrhus · Wail · Yokai

Sky Pirates

Leader: Nadakhan
Flintlocke · Dogshank · Doubloon · Monkey Wretch · Clancee · Bucko · Cyren · Skeleton Figurehead
Former Member: Squiffy

Ninjago Police

Police Commissioner · Tommy · Simon · Noonan · O'Doyle · Jimmy · Policeman · Night Watchman

Temple of Airjitzu Ghosts

Master Yang
Yang's Students: Chris · Martin · "Chuck"
Allies: Samukai · Pythor · Kozu · Cryptor · Chen

Shadow Army

Leader: Clouse

Vermillion

Creators: Acronix · Krux
Machia · Raggmunk · Blunck · Vermin · Rivett · Slackjaw · Tannin · Buffmillion

Sons of Garmadon

Leaders: Harumi · Lord Garmadon
Killow · Ultra Violet · Mr. E · Luke Cunningham · Chopper Maroon · Mohawk · Sawyer · Scooter · Buffer · "Snake Jaguar" · Colossus

Ninjago Royal House

Emperor of Ninjago · Empress of Ninjago · Princess Harumi · Hutchins · Royal Guards

Dragon Hunters

Leader: Heavy Metal
Jet Jack · Skullbreaker · Arkade · Muzzle · Daddy No Legs · Chew Toy · Talon · Nitro · "Rocky Dangerbuff" · "Dangerbuff Junior" · Stalwart Dangerbuff · Otto Pilot
Former Member: Iron Baron

Oni

Leader: The Omega

Pyro Vipers

Leader: Aspheera
Char · Pyro Destroyers · Pyro Slayers · Pyro Whippers
Former Members: Mambo the Fifth · Mambo's Advisor

Blizzard Samurai

Leader/Creator: Ice Emperor
General Vex · Grimfax · Blizzard Warriors · Blizzard Sword Masters · Blizzard Archers · Frostbeard

Formlings

Leader: Formling Leader
Akita · Kataru · Vex

Ice Fishers

Leader: Sorla
Uthaug · Boma

Explorers Club

Leader: Cecil Putnam
Percy Shippelton · Smythe · Underhill · Clutch Powers

Unagami's Army

Leader: Emperor Unagami
Sushimi · Aerial Drones
Red Visors: Red 27 · Red 29
Allies: The Mechanic · Captain Soto · Ultra Violet · Hausner · Richie

Rat Pack

Leader: Atta the Ratta
Hausner · Richie · Ritchie

Non-Canon

Quartet of Villains · Gahrann the Dreamer · Hibiki · Kirchonn the Invincible · Mask of Malice · Time Ninja · Lar · Seliel · Seliel's Father · Neido

Creatures

Grundles · Spykor · Starteeth · The Leviathan · Treehorns · Craglings · Mud Monsters · Geoatomic Rock Monsters · Ice Serpent · Wallipers · Colossus · Fire Fang · Elemental Cobras · Yetis
Dragons: Boreal · Cyber Dragon · Earth Dragon · Empire Dragon · Fire Dragon · Fire Dragon · Firstbourne · Ice Dragon · Ice Dragon · Lightning Dragon · Slab · Stormbringer · Stormbringer's Baby · Wind Dragon
Elemental Dragons: Golden Dragon · Elemental Earth Dragon · Elemental Fire Dragon · Elemental Form Dragon · Elemental Gravity Dragon · Elemental Lightning Dragon · Elemental Metal Dragon · Elemental Mind Dragon · Elemental Nature Dragon · Elemental Poison Dragon · Elemental Shadow Dragon · Elemental Smoke Dragon · Elemental Speed Dragon · Titanium Dragon · Elemental Water Dragon · Morro Dragon · Elemental Creation Dragon
Fusion Dragons: Ultra Dragon · Hydro Electric Dragon · Fusion Dragon

Other

Anthony Bruton Nelli · Antonia · Benny · Bob the Intern · Brad Tudabone · Carridi · Cathy· Claire · Cliff Gordon · Cragger · Dr. Berkman · Dr. Julien · Ed · Edna · First Spinjitzu Master · Fenwick · Finn · Fugi-Dove · Gene · Genn · Echo Zane · Harumi's Mother · Hageman Brothers · Harumi's Father · Hibiki · Hyper-Sonic · Jake · Jesper · Juggernaut · Khanjikhan · Khanjikhan's Father · Laval · Leroy · Lil' Nelson · Lou · Milton Dyer · Mistaké · Grumbmiller · Nadakhan's Mother · Nobu · Okino · Patty Keys · Postman · Racer Seven · Restaurant Owner · Robo Usher 3000 · Rodrigo · Rufus MacAllister · Warden Noble · Sammy · Sally · Scott · Tai-D · Tour Bus Driver · Phantom Ninja · Rachel Sparrow · Roise · Sparring Robot · Suzie Wheeler · Vlad Tutu · Wohira · Master Whoosh · Dr. Yost
Bizarro Ninja: Bizarro Cole · Bizarro Jay · Bizarro Zane · Bizarro Kai
League of Jays: Jay · Scott · Beta Jay 137 · Dee-Jay 81 · Jaybird 64 · Jaywalkin 238