Stalwart Dangerbuff

Ninja

Master Wu · Master Lloyd · Kai · Nya · Jay · Cole · Zane
Allies: Misako · Falcon · Cyrus Borg · P.I.X.A.L. · Ronin · Dareth
Former Members: Master Garmadon

Skulkin

Samukai · Wyplash · Kruncha · Frakjaw · Chopov · Nuckal · Krazi · Bonezai

Serpentine

Anacondrai: Arcturus · Pythor · Anacondrai Generals · Anacondrai Serpent
Fangpyre: Fangtom · Fangdam · Fang-Suei · Snappa
Venomari: Acidicus · Lizaru · Spitta · Lasha · Zoltar
Constrictai: Skalidor · Bytar · Chokun · Snike
Hypnobrai: Skales · Slithraa · Mezmo · Rattla · Selma · Skales Jr.
Other: The Great Devourer · Clancee

Pirates

Leader: Captain Soto
First Mate · No-Eyed Pete

Stone Army

Creator: The Overlord
General Kozu · Giant Stone Warrior · Stone Warrior · Stone Swordsman · Stone Scout

Nindroids

General Cryptor · Nindroid Drone · Nindroid Warrior · Min-Droid

Anacondrai Cultists

Leader: Chen
Clouse · Zugu · Eyezor · Kapau · Chope · Krait · Sleven

Elemental Masters

Current Elemental Masters: Ash · Bolobo · Chamille · Gravis · Griffin Turner · Jacob Pevsner · Karlof · Neuro · Paleman · Skylor · Tox
Previous Elemental Masters: Cole's Grandfather · Griffin Turner's Grandfather · Jay's Mother · Master of Gravity · Master of Ice · Master of Light · Master of Shadow · Master of Sound · Maya · Ray · Skylor's Mother

Ghost Warriors

Leader: The Preeminent
Morro · Chain Master Wrayth · Blade Master Bansha · Scythe Master Ghoultar · Bow Master Soul Archer
Ghost Ninja: Attila · Hackler · Howla · Ming · Spyder · Wooo
Ghost Warriors: Cowler · Cyrus · Ghurka · Pitch · Pyrrhus · Wail · Yokai

Sky Pirates

Leader: Nadakhan
Flintlocke · Dogshank · Doubloon · Monkey Wretch · Clancee · Bucko · Squiffy · Cyren · Skeleton Figurehead

Temple of Airjitzu Ghosts

Master Yang · Yang's Students

Shadow Army

Leader: Clouse

Vermillion

Creators: Acronix · Krux
Machia · Raggmunk · Blunck · Vermin · Rivett · Slackjaw · Tannin · Buffmillion

Sons of Garmadon

Leaders: Harumi · Lord Garmadon
Killow · Ultra Violet · Mr. E · Luke Cunningham · Chopper Maroon · Mohawk · Sawyer · Scooter · Buffer · "Snake Jaguar" · Colossus

Dragon Hunters

Leader: Heavy Metal
Jet Jack · Skullbreaker · Arkade · Muzzle · Daddy No Legs · Chew Toy · Talon · Nitro · "Rocky Dangerbuff" · "Dangerbuff Junior" · Stalwart Dangerbuff
Former Members: Iron Baron

Oni

Leader: The Omega
Former Members: Mistaké

Blizzard Samurai

Leader: Ice Emperor
General Vex · Blizzard Warriors · Blizzard Sword Masters · Blizzard Archers

Pyro Vipers

Leader: Aspheera
Char · Pyro Destroyers · Pyro Slayers · Pyro Whippers

Non-Canon

Quartet of Villains · Evil Bees · Gahrann the Dreamer · Hibiki · Ice Serpent · Kirchonn the Invincible · Mask of Malice · Time Ninja · Lar · Seliel · Seliel's Father · Neido

Creatures

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Dragons: Firstbourne · Fire Dragon (Realm of Oni and Dragons) · Lightning Dragon · Earth Dragon · Ice Dragon (Realm of Oni and Dragon) · Slab · Stormbringer · Stormbringer's Baby · Wind Dragon · Ice Dragon (Kingdom of Never-Realm)
Elemental Dragons: Golden Dragon · Elemental Earth Dragon · Elemental Fire Dragon · Elemental Form Dragon · Elemental Gravity Dragon · Elemental Lightning Dragon · Elemental Metal Dragon · Elemental Mind Dragon · Elemental Nature Dragon · Elemental Poison Dragon · Elemental Shadow Dragon · Elemental Smoke Dragon · Elemental Speed Dragon · Titanium Dragon · Elemental Water Dragon · Morro Dragon · Elemental Creation Dragon
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Other

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Bizarro Ninja: Bizarro Cole · Bizarro Jay · Bizarro Zane · Bizarro Kai